A FAJE possui uma infraestrutura adequada para o trabalho de formação do ser humano. No decorrer do tempo, foram realizadas várias adaptações e melhorias, tendo sido criados novos ambientes para atender às necessidades que surgiram.
a) Áreas internas
1º Bloco (área construída = 1o pavimento 604,86m² , 2o pavimento 577,46m², 3o pavimento 129,84m², subsolo 39,75m². Total = 1.351,91m²).
1o pavimento (604,86m2): Recepção; setor de administração (04 salas); refeitório de funcionários da Administração; sala do Departamento de Pessoal; secretarias do Departamento de Filosofia, do Departamento de Teologia, da Pós-Graduação, do Núcleo de Extensão e Especialização; gabinetes do diretor do Departamento de Teologia, do Coordenador Central de Extensão e Especialização, do Coordenador Central de Pós-Graduação, do Coordenador da Graduação em Filosofia; do Secretário Geral, do Coordenador de Serviços Gerais; sala de reuniões e atendimento; setor de tecnologia da informação; 04 conjuntos sanitários.
2o pavimento (577,46m2): Reitoria com sala de reuniões e de espera (com dois sanitários); secretaria da Reitoria; gabinete do Diretor do Departamento de Filosofia; 11 gabinetes para professores (com sanitários individuais); consultório do médico de trabalho; setor de publicações (duas salas); arquivo morto; sala de reunião; depósito de material de limpeza.
3o pavimento (129,84m2): Sala da Congregação; sala de espera; gabinete de professor; copa; instalações sanitárias.
Subsolo (39,75m2): serviço de papelaria e reprografia.
2º Bloco (área construída: 1.179,50m2)
1o pavimento (708,41m2): 03 salas de aula (70m2); sala de aula (35m2); sala de professores; área de convivência (180m2); 02 conjuntos sanitários; área de circulação; cantina.
2o pavimento: (471,09m2): 02 salas de aula (70m2); 02 salas de aula (52m2); 02 salas de estudo em grupo; sala da Coordenação do Curso de Teologia Pastoral; 02 conjuntos sanitários.
3º Bloco (área construída: 1.336m²): Bloco Dom Helder Câmara: 02 salas com capacidade para 15 alunos, sala com capacidade para 25 alunos; sala com capacidade para 45 alunos, sala com instalações de recursos audiovisuais com capacidade para 45 alunos; 02 salas de apoio; foyer do auditório; 02 conjuntos sanitários; auditório com capacidade para 170 pessoas; pequeno teatro de arena (no jardim).
4º Bloco (área construída: 1755m²): Biblioteca Padre Vaz (cf. detalhamento em 7.2.2).
5º Bloco (área construída: 579,05m2): Auditório Dom Luciano Mendes de Almeida: foyer; auditório com capacidade para 300 pessoas; instalações sanitárias e copa.
6º Bloco (área construída: 199m2): sala do Centro Acadêmico Tito de Alencar; sala do Centro Acadêmico Luciano Mendes de Almeida; sala da Coordenação da União de Grupos Alternativos de Estudo Pré-Vestibular (GRUPREV).
7º Bloco (área construída: 64,87m2): sala de descanso e convivência para funcionários; refeitório; 02 conjuntos sanitários; oficina de manutenção.
8º Bloco (área construída: 228,20m2): capela S. Inácio de Loyola (capacidade para 200 pessoas).
b) Áreas externas
• 02 quadras de esporte, sendo uma com iluminação noturna (1.454,13m2)
• Área verde (30.552m2)
• Área de estacionamento (250m2)
• Área de circulação
c) Campus
• Área total = 44.304m2
• Área construída = 15.401m2